Im Prinzip würde sich der 14 Tage Railpass sich für dich schon lohnen.
Der Pass kostet: 45,100 Yen
Allein der Shinkansen (Hikari) von Tokio nach Osaka und zurück kostet 27,500 Yen, Tokio-Nikko hin und zurück kostest auch ohne Shinkansen schon 5040 Yen. Narita - Tokio und zurück 2560 Yen. Da kommt schnell was zusammen.
Regionale Railpasse gibt es, schau mal unter:
http://www.japanrail.com/railpasses.php
http://www.jreast.co.jp/e/pass/index.html
Im Zentrum Tokios ist die U-Bahn aber praktischer. Des weiteren ist eine Einzelfahrt mit einer privaten Bahnlinie in den Ballungsgebieten in der Regel billiger, was einen JR-Regionalpass weniger attraktiv macht.
Andere preiswerte Möglichkeiten nach Osaka zu kommen sind
Busse oder zuschlagfreie Züge (siehe zum Beispiel unter "seishun 18" im jreast Link oben), allerdings erheblich zeitaufwendiger und anstrengender als mit dem Shinkansen.