Für Preisauskünfte von Zugfahrten ist die Seite
Hyperdia genial.
Laut Hyperdia (alles one-way):
Tokyo → Shin-Osaka: ~14.000 JPY, wenn du nicht den Nozomi nimmst
Osaka → Kyoto: 560 JPY, wenn man keinen Express benutzt
Osaka → Hiroshima: ~ 10.000 JPY ohne Nozomi
Macht nach aktuellem Wechselkurs und unter der Annahme, dass die Rückfahrten soviel kosten wie die Hinfahrten 429 €
Den Nozomi lasse ich deshalb weg, weil man den mit dem JR-Pass nicht benutzen kann (und er etwas teurer ist).
Du solltest allerdings bedenken, dass du bestimmt nicht nur für einen Tag nach Kyoto fährst und, dass du auch in Tokyo eventuell JR-Linien (Chuo-sen, Yamanote-sen) benutzt... Aber ich denke nicht, dass diese Kosten ausschlaggebend sein werden.